Сравнение возможностей

Возможность	pnpm	Yarn	npm
Поддержка воркспейсов	✔️	✔️	✔️
Изолированная node_modules	✔️ - По умолчанию	✔️	✔️
Не иерархичность node_modules	✔️	✔️	✔️ - По умолчанию
Авто-установка peerDependencies	✔️ - При помощи auto-install-peers=true	❌	✔️
Plug'n'Play	✔️	✔️ - По умолчанию	❌
Zero-Installs	❌	✔️	❌
Патчинг зависимостей	✔️	✔️	❌
Управление версиями Node.js	✔️	❌	❌
Имеет lock-файл	✔️ - pnpm-lock.yaml	✔️ - yarn.lock	✔️ - package-lock.json
Поддержка переопределений	✔️	✔️ - Via resolutions	✔️
Контенто-адресуемое хранилище	✔️	❌	❌
Динамическое выполнение пакетов	✔️ - При помощи pnpm dlx	✔️ - При помощи yarn dlx	✔️ - При помощи npx
Side-effects cache	✔️	❌	❌
Listing licenses	✔️ - Via pnpm licenses list	✔️ - Via a plugin	❌